据了解，沼气气柜中的橡胶密封膜长时间运行会产生老化、褶皱，并且皮膜随着气柜的升降会频繁拉伸，受到摩擦力和拉力之影响，构成了皮膜破而泄漏了沼气。密封角钢位置处皮膜紧固螺栓松动、密封腻子老化失效引起泄漏。
针对气柜密封系统泄漏的问题采用如下方法：
（1）通过气柜静置气密性试验，确认气柜是否泄漏。
（2）发现有泄漏的，在置换了沼气柜后，向沼气柜里面冲入了氮气或是空气，使用肥皂水进行试漏，查找出泄漏的起因并且妥善处理。
沼气脱硫设备压力表判断故障与处理方法：
1、不用气时，压力表显示压力下降，这说明自压力表前面的输配系统到沼气池的距离有漏水漏气的情况。压力先是快后变慢下降是漏水，均匀下降是漏气，需补漏。
2、显示压力表没压力，但有气可以烧，这说明池气箱未漏气，发酵间或是进、出料中间的中下部有漏水，需进行补漏。
3、压力表的显示压力相当高，但是气较快烧光，这说明料液过满或是气箱过小，应当抽出料液保障气箱容积。
4、压力表显示压力高，但燃烧成果不好，这有多种情况∶
①进风量不适宜，需调整风门;②沼气里面的量较少，需增进发酵∶③输气的管路过长，应缩短管路;
④沼气脱硫设备的各连接件、开关多或是内径较小以及有堵塞，需减少连接件、开关，更换或疏通管路。
二氧化碳
二氧化碳是沼气中只次于的主要成分。不同类型的底物在发酵产沼气过程中都会产生二氧化碳。底物转化生成沼气是一个复杂的过程，涉及多个阶段和不同类型的微生物菌样，二氧化碳可形成于不同的阶段。在产阶段，二氧化碳作为电子受体，也可被转化成。
二氧化碳会减低沼气热值，如果需要增加沼气热值(如用作车用燃气或并入管网)，应分离除去二氧化碳。沼气作为其他用途，例如，沼气发电或集中供气，沼气含有二氧化碳不会有大的问题，但是，二氧化碳溶于冷凝水形成碳酸，对管道和沼气脱硫设备有预定的腐蚀。